微生物分子诊断学

第一篇原理与方法
第一章微生物分子诊断学简介
第一节微生物分子诊断学简介
第二节临床样本处理及（核酸）提取方法
第三节体外核酸扩增技术
第四节扩增产物的检测和鉴定
第五节微生物分子诊断质量控制
第六节基因诊断技术在临床微生物学中的应用
第七节结束语
第二章临床标本处理及核酸提取方法
第一节标本处理在分子微生物检验中的地位
第二节常见分子微生物检测标本的处理方法
第三节实验样品的制备
第三章微生物分子诊断探针及杂交技术
第一节分子微生物探针
第二节各种分子微生物探针杂交技术的原理及特征
第三节分子微生物探针及杂交技术体系与流程的优化
第四节探针及杂交技术在微生物检测与鉴定中的应用
第四章体外核酸放大：PCR及其衍生技术
第一节靶核酸扩增方法
第二节PCR的其他模式
第三节PCR衍生技术
第四节信号放大扩增方法
第五节核酸放大技术在微生物检测中的应用
第六节核酸放大技术的局限性及挑战
第七节核酸放大技术的未来及展望
第五章体外核酸放大：实时荧光定量PCR技术
第一节实时荧光定量PCR（FQ—PCR）技术概述
第二节实时荧光定量PCR的方法介绍
第三节实时荧光定量PCR的实验方法
第四节FQ—PCR技术在临床微生物学中的应用
第六章体外核酸放大：其他靶放大技术
第一节体外核酸放大技术概述
第二节转录介导扩增
第三节依赖核酸系列的扩增
第四节链替代扩增
第五节解旋酶扩增
第七章体外核酸放大：探针放大技术
第一节各种探针放大技术的原理和特征
第二节探针放大在微生物检验中的应用举例
第三节探针放大的优势与不足
第四节探针放大技术的发展方向
第八章体外核酸放大：信号放大技术
第一节信号放大的原理和技术特征
第二节信号放大技术之间的比较
第三节信号放大技术在微生物检验应用中的举例
第四节信号放大技术的优势及缺陷
第五节信号放大技术未来发展趋势
第九章放大产物的检测及鉴定：凝胶电泳及毛细序列电泳
第一节凝胶电泳
第二节毛细序列电泳
第十章放大产物的检测及鉴定：实时检测探针
第一节荧光共振能量转移基础上的核酸扩增技术
第二节实时检测探针在微生物检测方面的应用
第十一章放大产物的检测及鉴定：酶联显色
第一节微孔板检测系统的原理
第二节微孔板检测系统的应用
第十二章放大产物的检测及鉴定：序列测定和焦磷酸测序
第一节传统测序技术
第二节焦磷酸测序技术
第三节新一代测序技术
第十三章放大产物的检测及鉴定：基因芯片
第一节基因芯片原理和基本概念
第二节基因芯片的几种基本分类和类型
第三节基因芯片在微生物诊断中的应用
第十四章新型多重PCR放大技术在微生物分子诊断中的应用
第一节多重PCR技术的原理
第二节多重PCR技术的优化
第三节多重PCR放大技术新进展
第四节多重PCR的应用
第十五章液态芯片技术在微生物分子诊断中的应用
第一节液态芯片技术简介
第二节液态核酸芯片检测实验方案
第三节液态蛋白质芯片检测实验方案
第四节液态芯片技术在病原微生物检测中的应用
第五节总结与展望
第十六章质谱技术在微生物分子诊断中的应用
第一节质谱技术简介
第二节质谱技术在微生物鉴定中的应用史
第三节MALDI—TOF MS用于微生物鉴定的原理及流程
第四节MALDI—TOF MS在临床微生物鉴定中的实际应用
第五节质谱技术在临床微生物鉴定中的挑战与展望
第十七章核酸序列测定技术在微生物分子诊断中的应用
第一节核酸序列测定技术的基本工作原理
第二节核酸序列测定技术在微生物研究中的应用
第三节展望
第十八章细菌性病原体分子分型技术简介
第一节分子分型方法
第二节分子分型的应用
第十九章微生物分子分型技术：脉冲场凝胶电泳
第一节脉冲场凝胶电泳技术
第二节脉冲场凝胶电泳的应用
第二十章微生物分子分型技术：多位点序列分析
第一节多位点序列分析技术
第二节多位点序列分析技术的应用
第二十一章分子生物学实验室设计及操作规程
第一节分子生物学实验室的生物等级要求
第二节分子生物学实验室的环境要求
第三节分子生物学实验室不同区域的操作规程
第四节进行分子生物学实验的人员要求
第五节去除污染的常用措施
第二十二章微生物分子诊断的质量保证与质量控制
第一节微生物分子诊断的质量保证与质量控制概述
第二节微生物分子诊断实验室能力验证
第三节能力验证国外实施现状
第四节能力验证国内实施现状
第五节总结与展望
第二十三章临床诊断实验室分子检测技术的建立、验证与核实
第一节涉及分子检测技术的机构、概念和名词简介
第二节针对感染性疾病的分子检测技术建立、验证与核实
第三节建立质量控制体系
第四节分子检测技术在临床应用过程中的几个注意事项
第五节交叉监控及效率评定测验
……
第二篇研究与应用
索引