Algal Photosynthesis: Mechanisms and Models

前言
第1部分 机理篇
第1章 藻类光合色素
1 叶绿体
2 类囊体膜的结构
3 光合色素
3.1 叶绿素
3.1.1 叶绿素的结构
3.1.2 叶绿素的吸收光谱
3.1.3 叶绿素在藻类中的分布
3.2 类胡萝卜素
3.2.1 类胡萝卜素的结构
3.2.2 类胡萝卜素的吸收光谱
3.3.1 藻胆蛋白的结构
3.3 藻胆蛋白
3.2.3 类胡萝卜素在藻类中的分布
3.3.2 藻胆蛋白的吸收光谱
3.3.3 藻胆蛋白在藻类中的分布
4 捕光色素蛋白复合体
4.1 叶绿素/类胡萝卜素蛋白复合体
4.1.1 叶绿素a/b-类胡萝卜素蛋白复合体
4.1.2 叶绿素a/c-类胡萝卜素蛋白复合体
4.1.3 叶绿素a-类胡萝卜素蛋白复合体
4.2 藻胆体
参考文献
第2章 光合作用的基本原理
1 光合膜
2 光系统的结构
2.1 PSⅡ核心复合体
2.2 PSⅠ核心复合体
3 光能的吸收和传递
4 类囊体膜上的电子传递
4.1 Z-图
4.2 水的裂解
4.2.1 S态循环
4.2.2 锰和其它因子的作用
4.3 PS Ⅱ——依赖光的水-PQ氧化还原酶
4.4 电子经过Cyt b6/f复合体的传递
4.4.1 Cyt b6/f复合体的结构
4.4.2 Q循环
4.5 质蓝素
4.6 PS Ⅰ——依赖光的PC-Fd氧化还原酶
4.7 电子从PS Ⅰ到NADP+的传递
4.8 电子传递抑制剂
5.1 电子传递和ATP合成的偶联
4.9 环式电子传递与假环式电子传递
5 ATP的合成
5.2 化学渗透假说
5.3 ATP合成酶
5.4 ATP合成酶的结合变化和旋转催化机制
6 CO2固定
6.1 核酮糖-1，5-二磷酸羧化/加氧酶
6.2 Calvin循环
6.3 Calvin循环的调节
6.4 藻类中的C4途径
7 光呼吸
参考文献
第3章 活体叶绿素荧光
1 叶绿素荧光的研究历史
2 叶绿素荧光的产生及其量子产量
3 叶绿素荧光光谱
4 光合作用原初光化学反应
5 叶绿素荧光诱导动力学与PSⅡ的异质性
5.1 叶绿素荧光诱导动力学
5.1.1 叶绿素荧光诱导动力学的快相
5.1.2 叶绿素荧光诱导动力学的慢相
5.2 PSⅡ的异质性
5.2.1 PSⅡ的天线异质性
5.2.2 PSⅡ的还原侧异质性
5.2.3 PSⅡ异质性的动力学及生理意义
6 叶绿素荧光诱导动力学的测定和常用荧光参数
6.1 PAM荧光仪的测量原理
6.2 叶绿素荧光诱导动力学中的常用术语
6.3 常用叶绿素荧光参数
6.3.1 与叶绿素荧光动力学快相有关的参数
6.3.2 与叶绿素荧光动力学慢相有关的参数
7 非光化学淬灭
7.1 叶绿素荧光淬灭的暗弛豫动力学和非光化学淬灭主要组分的检测
7.2 qE
7.3 qT
7.4 q？
参考文献
第4章 藻类光损伤
1 光损伤与光饱和曲线
2 光损伤的作用位点
3 受体侧和供体侧光损伤机制
4 低光综合症
5 稳态光合作用时的光损伤机制
5.1 光损伤与光强的关系
5.2 稳态光合作用时的光损伤机制
5.3.1 电子传递和光合作用可以减轻光损伤
5.3 稳态光合作用时光损伤的影响因素
5.3.2 低温可以加剧光损伤
5.3.3 光损伤受QA氧化还原状态的调节
6 PSⅡ损伤与修复的循环——D1蛋白周转
6.1 D1蛋白的降解
6.2 D1蛋白的合成、插入和PSⅡ的装配
7 紫外线对PSⅡ的光损伤
参考文献
第5章 藻类光保护
1 通过3Chl途径耗散过剩光能
2 与△pH和叶黄素循环有关的光保护机制
2.1 叶黄素循环
2.1.1 紫黄素循环
2.1.3 5.6-环氧化黄体素循环
2.2 叶黄素循环的光保护机制及△pH的作用
2.1.2 硅甲藻黄素循环
2.3 qE淬灭机制
2.3.1 直接淬灭机制
2.3.2 间接淬灭机制
3 与激发能分配有关的光保护机制
3.1 绿藻中的状态转换机制
3.2 蓝藻和红藻中的状态转换
4 反应中心防御光损伤的长期机制——D1蛋白的快速周转
5 通过光化学反应的光保护机制
5.1 同化的线性电子传递
5.2 依赖氧的电子传递
5.2.1 光呼吸
5.2.2 水-水循环
5.2.3 叶绿体呼吸
5.3 环式电子传递
6.1.1 类胡萝卜素
6 活性氧的清除
6.1 抗氧化剂
6.1.2 生育酚
6.1.3 抗坏血酸
6.1.4 谷胱甘肽
6.2 抗氧化酶
参考文献
第2部分 模型篇
第6章 藻类荧光诱导模型
1 光合单位
2 光合膜上的天线组织
3 PSⅡ的结构和功能
4 PSⅡ荧光模型
4.1 色素激发与荧光产量
4.2 陷阱限制与晶格模型
4.4 快速激子平衡
4.3 漏斗模型
4.5 色素群和Butler模型
4.6 RRP模型的结构与参数
4.7 模型的合理性
5 荧光产量与光化学产量的关系
5.1 可变荧光与光化学产量
5.2 还原QA时的陷阱闭合
6 影响荧光产量和曲线的主要因子
6.1 非光化学淬灭
6.2 PSⅡ异质性
7 PSⅡ的连接性
8 二组分模型的表征
9 RRP模型的表征
9.4 RRP模型
9.3 PSU中激发态的陷阱
9.2 激发子的反应中心陷阱
9.1 激发态在单个色素上的衰退
9.5 连接单元模型
9.5.1 荧光和光化学量子产量
9.5.2 荧光诱导动力学
9.5.3 Genty方程
9.5.4 连接模型的特例——湖泊模型
9.5.5 Stern-Volmer方程
9.5.6 荧光诱导曲线的互补面积
9.5.7 参数J
10 双电子门模型
11 荧光诱导模型改进中存在的问题
参考文献
第7章 藻类光合作用响应曲线
1 光合作用-光强响应的经验模型
2 闪光产量和Webb公式的生物学基础
3 光合作用响应的机理模型
3.1 Megard模型
3.2 Eilers-Peeters模型
4 Han模型
4.1 光合单位与光量子效率
4.2 光饱和曲线
4.3 具有光抑制的P-I曲线
4.4 光合作用光抑制的本质
4.5 光保护对光合作用响应的影响
4.6 光适应对光合作用响应的影响
5 光合作用动态
5.1 光适应对光合作用动态的影响
5.2 光抑制对光合作用动态的影响——DYPHORA
5.3 基于D1蛋白破坏的光合作用动态
5.4 基于PSⅡ损伤的光合作用动态
参考文献
5.5 PSⅡ动力学模型的生物学基础
第8章 海洋光合产量与计算
1 水柱初级生产
1.1 初级生产力的测量
1.1.1 14C法
1.1.2 18O法
1.2 影响水柱初级生产的因素
1.2.1 生物量
1.2.2 光
1.2.3 其它环境因子的影响
1.3 水柱初级生产力的时空分布
1.3.1 不同纬度的季节变化
1.3.2 不同水文特征海域的初级生产
1.4.3 时间整合模型
1.4.4 深度整合模型
1.4 水柱初级生产力模型
1.4.2 波长整合模型
1.4.1 波长积分模型
2 海洋浮游植物生物量分布
2.1 叶绿素遥感
2.2 水柱浮游植物生物量
2.2.1 垂直分布
2.2.2 水柱生物量计算
2.3 生物量的全球时空分布
3 全球海洋初级生产估算
3.1 基于海洋生产力类型的统计估算
3.2 基于卫星遥感叶绿素浓度的模型估算
3.2.1 海洋分区模型
3.2.2 查表模型
3.2.3 垂向归纳模型
4 全球海洋光合作用与生物地球化学循环
4.1 海洋生物泵
4.2 N、P循环
4.3 海洋光合作用与地质变迁
参考文献
第9章 藻类CO2浓缩机制与模型
1 水体碳环境
2 CCM机制的判定
3 藻类CCM运行机理
3.1 蓝藻
3.1.1 蓝藻CCM的基本原理
3.1.2 转运系统
3.1.3 羧化体
3.1.4 无机碳吸收的动态变化
3.2 真核微藻
3.2.1 无机碳泵的种类和位置
3.2.2 CO2浓度提高的部位和机制
3.2.3 碳酐酶的分布
3.3 大型藻类
3.3.1 水生被子植物的HCO3-利用
3.3.2 轮藻的HCO3-利用
3.3.3 其它大型藻类
4 CCM的生物学意义
5 数值模型
5.1 Reinhold模型
5.2 Fridlyang模型
5.3 光强对CCM运转的影响
参考文献
后记