Calculations in molecular biology and biotechnology : a guide to mathematics in the laboratory =...

前言.

第1章 科学计数法和公制前缀

简介

有效数字

计算中有效数字的舍入

指数和科学计数法

科学计数法计数

科学计数法与十进制计数法之间的转换

科学计数法中加减法的表达

科学计数法中乘除法的表达

公制前缀

计量单位转换因子和因次分析

第2章 溶液、混合液和培养基

简介

稀释计算：常规方法

浓缩

配制百分比浓度溶液

百分比浓度溶液的稀释方法

摩尔和分子量的概念

摩尔浓度

.摩尔浓度溶液的稀释方法

摩尔浓度转换为百分比浓度

百分比浓度转换为摩尔浓度

当量

ph

pka和汉—哈氏方程

第3章 细胞生长

细菌生长曲线

举例／例题

控制细胞浓度

在直角坐标系中绘制od550随时间变化的曲线

在直角坐标系中绘制od550的对数值随时间变化的曲线

对数值的确定

样品的od550转换为对数值

od550的对数值随时间的变化

绘制细胞浓度的对数随时间变化的曲线

对数值的确定

计算世代时间

斜率和细胞生长常数

世代时间

在半对数坐标系中表示细胞生长

绘制od550随时间变化的半对数曲线

根据od550随时间变化的半对数曲线估算世代时间

绘制细胞浓度随时间变化的半对数曲线

根据细胞浓度随时间变化的半对数曲线直接估算世代时间

绘制细胞密度与od550的半对数曲线

波动试验

波动试验实例

方差

突变率的计算

泊松分布

用泊松分布计算突变率

根据波动试验数据采用绘图法计算突变率

采用涂板法确定突变率

血球记数法测定细胞浓度

第4章 噬菌体

简介

感染复制数

概率和感染复制数

噬菌体效价的测定

噬菌体的稀释

裂解量的测定

第5章 核酸定量

紫外分光光度法测定核酸含量

测定双链dna的浓度

运用吸光度和消光系数计算双链dna的浓度

采用毫摩尔(mm)为单位计算dna浓度

单链dna分子浓度的计算

采用／ug／ml为单位表示单链dna分子的浓度

采用pmol／ul为单位表示大分子量的单链dna分子的浓度

采用mm为单位表示小分子量的dna分子(ssdna)浓度

寡核苷酸定量

od单位

采用ug／ml为单位表示寡核苷酸的浓度

采用pmol／ul为单位表示寡核苷酸的浓度

rna浓度的测定

分子量、摩尔浓度和核酸片段的长度

采用琼脂糖凝胶电泳法(eb染色)测定dna浓度

第6章 用放射性同位素标记核酸

简介

运用放射能：居里

估算质粒的拷贝数

用缺口平移(nick translation)法标记dna

缺口平移法检测放射性标记率

缺口平移法产物的比放射性计算

用随机引物标记dna

随机引物标记——标记率

随机引物标记——计算理论产量..

随机引物标记——计算实际产量

随机引物标记——计算产物的比活性

用末端转移酶标记3'末端

用末端转移酶标记3'末端——标记率

用末端转移酶标记3'末端——计算产物的比活性

cdna文库的合成

第一链cdna文库的构建

第二链cdna文库的构建

同聚物加尾(反应)

体外转录

第7章 寡核苷酸合成

简介

合成产量

用dmt cation assay方法估算阶段产量和总产量

总产量的计算

阶段产量的计算

每一步反应中碱基所增加的核苷的微摩尔量的计算第8章 聚合酶链式反应(pcr)

简介

模板与扩增

指数扩增

pcr扩增效率

计算靶序列tm值

扩增引物

扩增引物tm值

根据盐浓度、g／c含量和dna长度计算tm值

根据邻近相互作用计算tm值

脱氧核糖核苷酸

dna聚合酶

dna聚合酶错误率

定量pcr

第9章 dna重组

简介

限制性核酸内切酶

限制性核算内切酶的切点频率

计算酶切片段末端量

多酶切的片段末端量

连接

用λ衍生载体连接

重组λ基因组的组装

用质粒载体连接

转化效率

基因组文库：你需要多少克隆?

cdna文库：多少克隆足以构成文库?

表达文库

用dna探针筛选重组文库

寡核苷酸探针

杂交所需条件

用双链dna探针杂交

凝胶电泳法测定dna片段的大小

用bal 31核酸酶嵌套切除

第10章 蛋白质

简介

用吸收系数和消光系数估算蛋白质浓度

吸收系数与摩尔消光系数之间的联系

蛋白质消光系数的计算

mg／ml浓度与摩尔浓度之间的联系

用280 nm吸收值测定有dna污染的蛋白质浓度

用205 nm吸收值测定蛋白质浓度

用205 nm吸收值测定有dna污染的蛋白质浓度

用比色法测定蛋白质浓度—bradford分析

β—半乳糖苷酶应用于启动子活性与基因表达

培养细胞中β—牛乳糖苷酶活性的测定

比活性

分析纯化提取物中的β—半乳糖苷酶活性

cat分析

计算cat分子数

报告分析中使用荧光素酶

体外翻译——氨基酸整合率的测定

第11章 离心

简介

相对离心力(g)

g与rpm的转换

用列线图(nomogram)计算g和rpm

计算沉降时间

第12章 法医子

简介

等位基因与基因型

计算基因型频率

计算等位基因频率

hardy-weinberg方程与期望基因型频率的计算

卡方检验(x2检验)：观测值与期望值的比较

样本方差

样本标准差

pi：包含力

pd：分辩力

dna分型与加权平均法

乘法法则

索引...