脂质组学—脂质的综合质谱分析

*篇导 论

1 脂质与脂质组学

1. 1 脂质

1. 1. 1 定义

1. 1. 2 分类

1. 2 脂质组学

1. 2. 1 定义

1. 2. 2 脂质组学发展史

参考文献

2 脂质组学的质谱分析

2. 1 电离技术

2. 1. 1 电喷雾电离

2. 1. 2 基质辅助激光解吸 / 离子化

2. 2 质量分析器

2. 2. 1 四极杆质量分析器

2. 2. 2 飞行时间质量分析器

2. 2. 3 离子阱质量分析器

2. 3 检测器6

2. 4 串联质谱技术

2. 4. 1 产物离子分析

2. 4. 2 中性丢失扫描

2. 4. 3 前体离子扫描

2. 4. 4 选择反应监测

2. 4. 5 串联质谱技术

2. 5 质谱分析脂质的其他*进展

2. 5. 1 离子淌度质谱

2. 5. 2 解吸电喷雾电离

参考文献

3 基于质谱的脂质组学

3. 1 引言

3. 2 鸟枪法脂质组学

3. 2. 1 直接进样装?

3. 2. 2 鸟枪法脂质组学的特点

3. 2. 3 鸟枪法脂质组学

3. 2. 4 优缺点5

3. 3 基于 LC-MS 的脂质组学方法

3. 3. 1 概述

3. 3. 2 基于 LC-MS 的脂质组学方法

3. 3. 3 优点和缺点

3. 3. 4 LC-MS 分离后脂质的鉴定

3. 4 脂质组学中的 MALDI-MS

3. 4. 1 概述

3. 4. 2 脂质提取物的分析

3. 4. 3 优点和缺点

3. 4. 4 MALDI-MS 在脂质组学中的研究进展

参考文献

4 质谱技术在脂质组学应用中的变量因素

4. 1 引言

4. 2 脂质提取过程中的变量因素(即多重提取条件)

4. 2. 1 pH

4. 2. 2 溶剂极性

4. 2. 3 脂质固有的化学性质

4. 3 进样溶液中的变量因素

4. 3. 1 极性、组成、离子对以及其他变量

4. 3. 2 改性剂的含量及组成

4. 3. 3 进样溶液中的脂质浓度

4. 4 离子化过程中的变量因素

4. 4. 1 离子源温度

4. 4. 2 喷雾电压

4. 4. 3 进样 / 流动相的流速

4. 5 MS / MS 扫描监测过程中的结构单元

4. 5. 1 前体离子扫描中碎片离子的 m / z

4. 5. 2 中性丢失扫描中中性丢失片段的质量

4. 5. 3 产物离子质谱分析中的结构单元碎片

4. 6 碰撞过程中的变量

4. 6. 1 碰撞能量

4. 6. 2 碰撞气压

4. 6. 3 碰撞气体类型

4. 7 分离过程中的变量

4. 7. 1 源内分离中的电荷性质

4. 7. 2 LC 分离中的洗脱时间

4. 7. 3 MALDI 中选择离子化的基质

4. 7. 4 离子淌度分离中的漂移时间(或碰撞截面)

4. 8 结论

参考文献

5 生物信息学在脂质组学中的应用

5. 1 引言

5. 2 脂质文库和数据库

5. 2. 1 脂质代谢途径研究计划(Lipid MAPS)结构数据库

5. 2. 2 基于结构单元概念的理论数据库

5. 2. 3 LipidBlast - 电子串联质谱库

5. 2. 4 METLIN 数据库

5. 2. 5 人类代谢组数据库

5. 2. 6 LipidBank 数据库

5. 3 用于自动化脂质数据处理的生物信息学工具

5. 3. 1 LC-MS 谱图处理

5. 3. 2 生物统计分析和可视化

5. 3. 3 脂质种类结构的解释

5. 3. 4 用于常见数据处理的软件包

5. 4 脂质网络 / 通路分析和建模的生物信息学

5. 4. 1 脂质网络 / 通路的重建

5. 4. 2 模拟用于解释生物合成途径的脂质组学数据

5. 4. 3 空间分布和生物物理背景建模

5. 5 “组学”整合

5. 5. 1 脂质组学与其他组学的整合

5. 5. 2 脂质组学为基因组学分析提供指引

参考文献

第二篇脂质的表征

6 简介

6. 1 脂质结构表征

6. 2 脂质定性的模式识别

6. 2. 1 模式识别的基本原则

6. 2. 2 应用举例

6. 2. 3 小结

参考文献

7 甘油磷脂的裂解特征

7. 1 引言

7. 2 磷脂酰胆碱(PC)

7. 2. 1 正离子模式

7. 2. 2 负离子模式

7. 3 磷脂酰乙醇胺(PE)

7. 3. 1 正离子模式

7. 3. 2 负离子模式

7. 4 磷脂酰肌醇(PI)和磷脂酰肌醇磷酸

7. 4. 1 正离子模式

7. 4. 2 负离子模式

7. 5 磷脂酰丝氨酸(PS)

7. 5. 1 正离子模式

7. 5. 2 负离子模式

7. 6 磷脂酰甘油(PG)

7. 6. 1 正离子模式

7. 6. 2 负离子模式

7. 7 磷脂酸(PA)

7. 7. 1 正离子模式

7. 7. 2 负离子模式

7. 8 心磷脂(CL)

7. 9 溶血甘油磷脂(lysoGLP)

7. 9. 1 溶血卵磷脂(LPC)

7. 9. 2 溶血磷脂酰乙醇胺(LPE)

7. 9. 3 阴离子溶血甘油磷脂(anionic lysoGPL)

7. 10 其他甘油磷脂

7. 10. 1 N-酰基化磷脂酰乙醇胺

7. 10. 2 N-酰基化磷脂酰丝氨酸

7. 10. 3 酰基磷脂酸甘油

7. 10. 4 双(单酰甘油)磷酸酯(BMP)

7. 10. 5 环状磷脂酸

参考文献

8 鞘脂的裂解特征

8. 1 引言

8. 2 神经酰胺

8. 2. 1 正离子模式

8. 2. 2 负离子模式

8. 3 神经鞘磷脂

8. 3. 1 正离子模式

8. 3. 2 负离子模式

8. 4 脑苷脂

8. 4. 1 正离子模式

8. 4. 2 负离子模式

8. 5 硫苷脂

8. 6 寡糖基神经酰胺与神经节苷脂

8. 7 肌醇磷酸神经酰胺

8. 8 鞘脂的代谢产物

8. 8. 1 鞘氨醇骨架

8. 8. 2 1-磷酸鞘氨醇

8. 8. 3 溶血鞘磷脂

8. 8. 4 神经鞘氨醇半乳糖苷

参考文献

9 甘油脂的裂解特征

9. 1 引言

9. 2 甘油单酯

9. 3 甘油二酯

9. 4 甘油三酯

9. 5 已糖基甘油二酯

9. 6 其他糖脂

参考文献

10 脂肪酸和改性脂肪酸的裂解特征

10. 1 引言

10. 2 游离脂肪酸

10. 2. 1 未衍生化的游离脂肪酸

10. 2. 2 衍生化的游离脂肪酸

10. 3 改性脂肪酸

10. 4 脂肪酸组学

参考文献

11 其他生物活性脂质代谢物的裂解特征

11. 1 引言

11. 2 酰基肉碱

11. 3 酰基辅酶 A

11. 4 内源性大麻素

11. 4. 1 N-酰基乙醇胺

11. 4. 2 2-酰基丙三醇

11. 4. 3 N-酰基氨基酸

11. 5 4-羟基烯醛

11. 6 氯化脂质

11. 7 固醇和氧固醇

11. 8 脂肪酸-羟基脂肪酸

参考文献

12 脂质的质谱成像分析

12. 1 引言

12. 1. 1 适用于脂质质谱成像的样品

12. 1. 2 样品处理 / 准备

12. 1. 3 基质的应用

12. 1. 4 数据处理

12. 2 MALDI-MS 成像

12. 3 二次离子质谱成像

12. 4 DESI-MS 成像

12. 5 离子淌度成像

12. 6 脂质质谱成像分析的优点和缺点

12. 6. 1 优点

12. 6. 2 局限性

参考文献

第三篇脂质的定量

13 样品前处理

13. 1 引言

13. 2 采样、储存及相关问题

13. 2. 1 采样

13. 2. 2 萃取前的样品储存

13. 2. 3 *限度地减少自动氧化

13. 3 脂质萃取的原则与方法

13. 3. 1 脂质的萃取原则

13. 3. 2 内标

13. 3. 3 脂质萃取方法

13. 3. 4 脂质萃取过程中的注意事项

13. 3. 5 脂质萃取物的储存

参考文献

14 脂质组学中各个脂质的定量分析

14. 1 引言

14. 2 脂质质谱定量原理

14. 3 脂质定量方法

14. 3. 1 串联质谱法

14. 3. 2 多维质谱“鸟枪法”脂质组学中的两步法定量

14. 3. 3 选择离子监测模式(SIM)

14. 3. 4 选择反应监测模式(SRM)

14. 3. 5 基于高准确度质谱的定量方法

参考文献

15 影响脂质精确定量的因素

15. 1 引言

15. 2 脂质聚合

15. 3 定量分析的线性动态范围

15. 4 串联质谱法定量分析脂质时的基本要素

15. 5 离子抑制

15. 6 质谱基线

15. 7 同位素的影响

15. 8 定量分析所用内标的*小数量

15. 9 源内裂解

15. 10 溶剂的质量

15. 11 脂质定量分析中的其他方面

参考文献

16 数据质量控制与分析

16. 1 引言

16. 2 数据质量控制

16. 3 通过识别脂质代谢途径进行数据分析

16. 3. 1 鞘脂代谢途径网络

16. 3. 2 甘油磷脂的生物合成途径网络

16. 3. 3 甘油脂的代谢

16. 3. 4 不同脂质之间的相互关

16. 4 基于脂质功能的数据分析

16. 4. 1 作为细胞膜成分的脂质

16. 4. 2 脂质作为细胞能量储存库

16. 4. 3 脂质信号分子

16. 4. 4 脂质在细胞内的其他作用

16. 5 由于样品不均匀性和细胞区室的存在导致的数据分析复杂性

16. 6 整合“组学”数据进行数据验证

参考文献

第四篇脂质组学在生物医学及生物学领域的应用

17 关于健康和疾病的脂质组学

17. 1 引言

17. 2 糖尿病和肥胖症

17. 3 心血管疾病

17. 4 非酒精性脂肪肝

17. 5 阿尔茨海默病

17. 6 精神疾病

17. 7 癌症

17. 8 营养学中的脂质组学

17. 8. 1 脂质组学在特殊膳食或挑战性试验研究中的应用

17. 8. 2 脂质组学在食品质量控制方面的应用

参考文献

18 植物脂质组学

18. 1 引言

18. 2 植物脂质组中的特殊脂质

18. 2. 1 半乳糖脂

18. 2. 2 鞘脂

18. 2. 3 固醇及其衍生物

18. 2. 4 硫脂

18. 2. 5 脂质 A 及其中间体

18. 3 脂质组学在植物生物学中的应用

18. 3. 1 应激诱导的植物脂质体变化

18. 3. 2 植物生长发育过程中脂质体的变化

18. 3. 3 脂质组学在基因功能表征中的应用

18. 3. 4 脂质组学有助于改善转基因食品的质量

参考文献

19 酵母菌和结核分枝杆菌的脂质组学

19. 1 引言

19. 2 酵母脂质组学

19. 2. 1 酵母脂质组质谱分析策略

19. 2. 2 酵母脂质组的定量分析

19. 2. 3 不同酵母菌株的脂质组学

19. 2. 4 酵母脂质组学对脂质合成及功能的影响

19. 2. 5 生长条件对酵母脂质组的影响

19. 3 结核分枝杆菌的脂质组学

参考文献

20 细胞器和亚细胞膜中的脂质组学

20. 1 引言

20. 2 高尔基体

20. 3 脂滴

20. 4 脂筏

20. 5 线粒体

20. 6 细胞核

20. 7 结论

参考文献

索引