第二代测序信息处理
副标题：无
分类号：
ISBN：9787030406736
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简介
《第二代测序信息处理》几乎涵盖了NGS 技术在生命科学领域的全部应用，包括从头测序（含基因组注释）、针对稀有变异检测和元基因组研究的扩增子测序、染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）、RNA 测序（RNA-seq）和肿瘤体细胞变异检测（包括单碱基替换、插入、缺失和易位）等。通过广泛使用的一线软件充分讨论数据分析方法，详述最优工作流程（包括部分学习指南），实用性强、可靠性强、专业指导性强。
目录
目录
《新生物学丛书》丛书序
译者前言
前言
1 DNA测序简介 Stuart M. Brown 1
2测序信息学的历史 Stuart M. Brown 21
3 第二代测序数据的可视化 Phillip Ross Smith，Kranti Konganti和 Stuart M. Brown 34
4 DNA序列比对 Efstratios Efstathiadis 48
5 用广义 de Bruijn有向图算法组装基因组 D. Frank Hsu 62
6 用短序列读段从头组装细菌基因组 Silvia Argimon和 Stuart M. Brown 73
7 基因组注释 Steven Shen 84
8 使用第二代测序技术检测序列变异 Jinhua Wang，Zuojian Tang和 Stuart M. Brown 96
9 ChIP-seq Zuojian Tang，Christina Schweikert，D. Frank Hsu和 Stuart M. Brown 104
10 使用第二代测序进行 RNA测序 Stuart M. Brown，Jeremy Goecks和 James Taylor 129
11元基因组学 Alexander Alekseyenko和 Stuart M. Brown 143
12 DNA测序信息学中的高性能计算 Efstratios Efstathiadis和 Eric R. Peskin 149
术语表 165
索引 174
彩图
《新生物学丛书》丛书序
译者前言
前言
1 DNA测序简介 Stuart M. Brown 1
2测序信息学的历史 Stuart M. Brown 21
3 第二代测序数据的可视化 Phillip Ross Smith，Kranti Konganti和 Stuart M. Brown 34
4 DNA序列比对 Efstratios Efstathiadis 48
5 用广义 de Bruijn有向图算法组装基因组 D. Frank Hsu 62
6 用短序列读段从头组装细菌基因组 Silvia Argimon和 Stuart M. Brown 73
7 基因组注释 Steven Shen 84
8 使用第二代测序技术检测序列变异 Jinhua Wang，Zuojian Tang和 Stuart M. Brown 96
9 ChIP-seq Zuojian Tang，Christina Schweikert，D. Frank Hsu和 Stuart M. Brown 104
10 使用第二代测序进行 RNA测序 Stuart M. Brown，Jeremy Goecks和 James Taylor 129
11元基因组学 Alexander Alekseyenko和 Stuart M. Brown 143
12 DNA测序信息学中的高性能计算 Efstratios Efstathiadis和 Eric R. Peskin 149
术语表 165
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第二代测序信息处理
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